培養(yǎng)目標不同、報考條件不同、招生專業(yè)不同、調劑要求不同、入學難度不同、收費標準不同、學制不同、導師制度不同、學位論文不同、讀博方式不同。
培養(yǎng)目標不同：專碩以專業(yè)實踐為導向，重視實踐和應用；學碩以研究為導向，偏重理論和研究。
培養(yǎng)方式不同：專碩注重培養(yǎng)學生研究實踐問題的意識和能力，在學習過程中，至少有為期半年的實踐環(huán)節(jié)；學碩側重于加強基礎理論的學習，重點培養(yǎng)學生從事科學研究創(chuàng)新工作的能力和素質。
報考條件不同：專碩，部分專業(yè)報考要求和學碩相同，但其中工商管理、公共管理、工程管理、旅游管理、工程碩士中的項目管理、教育碩士中的教育管理、體育碩士中的競賽組織專業(yè)，報考條件為：本科畢業(yè)+3年以上工作經(jīng)驗；或獲得國家承認的高職高專畢業(yè)學歷或本科結業(yè)后，符合招生單位相關學業(yè)要求，達到本科畢業(yè)同等學歷并有5年以上工作經(jīng)驗；或獲得碩士或博士學位后有2年以上工作經(jīng)驗。學碩，國家承認的本科應屆畢業(yè)生（普通高校、成人高校、普通高校舉辦的成人高等學歷教育應屆本科畢業(yè)生）及自學考試和網(wǎng)絡教育屆時可畢業(yè)本科生，錄取當年9月1日前須取得國家承認的本科畢業(yè)證書；具有國家承認的大學本科畢業(yè)學歷的人員；獲得國家承認的高職高專畢業(yè)學歷后滿2年（從畢業(yè)后到錄取當年9月1日，下同）或2年以上的，以及國家承認學歷的本科結業(yè)生，符合招生單位根據(jù)本單位的培養(yǎng)目標對考生提出的具體學業(yè)要求，按本科畢業(yè)生同等學歷身份報考；已獲碩士、博士學位的人員。
招生專業(yè)不同：專碩招生比較有針對性，包括40個專業(yè)：金融、應用統(tǒng)計、稅務、國際商務、保險、資產(chǎn)評估、審計、法律、社會工作、警務、教育、體育、漢語國際教育、應用心理、翻譯、新聞與傳播、出版、文物與博物館、建筑學、工程、城市規(guī)劃、農(nóng)業(yè)推廣、獸醫(yī)、風景園林、林業(yè)、臨床醫(yī)學、公共衛(wèi)生、護理、藥學、中藥學、中醫(yī)、軍事、工商管理、公共管理、會計、旅游管理、圖書情報、工程管理、藝術等。學碩，包括哲學、經(jīng)濟學、法學、教育學、文學、歷史學、理學、工學、農(nóng)學、醫(yī)學、軍事學、管理學、藝術學13大學科，及下設的一級學科、二級學科，涵蓋所有的專業(yè)方向。
調劑要求不同：調劑基本條件，初試科目與調入專業(yè)初試科目相同或相近，其中統(tǒng)考科目原則上應相同，學碩的考試科目一般可以涵蓋專碩的初級科目或達到專碩的考試難度，因此調劑一般為學碩向專碩調劑。專碩的考試科目和考試難度決定了它幾乎沒有調劑到學碩的可能性，就是學碩可以調劑到專碩，但專碩不能調劑到學碩。臨床醫(yī)學類專碩相反，專碩的考生可以調劑到其他專業(yè)，但其他專業(yè)的考生（含醫(yī)學學術學位）的考生不能調劑到臨床醫(yī)學類專業(yè)學位。
入學難度不同：對大部分專業(yè)來說，專碩難度較學碩略低。專碩公共課英語多考英語二，學碩英語多考英語一，難度較大。專碩補考公共課數(shù)學或考數(shù)三、經(jīng)濟類聯(lián)考綜合能力，難度相對較??；學術數(shù)學考數(shù)一、數(shù)二、數(shù)三、數(shù)學（農(nóng)）或招生單位自命題理學數(shù)學，難度較大。
收費標準不同：學碩收費標準，原則上每年碩士生不超過8000元、博士生不超過10000元。
學制不同：專碩學制一般為2-3年，學碩學制一般為3年。具體情況依各招生單位當年政策為準。
導師制度不同：專碩實行雙導師制，學碩實行單導師制
學位論文不同：專碩的論文必須強化應用導向，形式可多種多樣。學碩強調科學理論研究與原創(chuàng)學術創(chuàng)新，形式相對傳統(tǒng)，一般為學術性論文。
讀博方式不同：專碩一般不能碩博連讀，碩士畢業(yè)后進行考博。學碩可以通過自己的導師直接讀博，不用參加全國統(tǒng)考，也就是我們所說的直博或碩博連讀。
